| LE CHAT FRANCAISÉtablissement 00012 | 105 246 433 | Besançon | 15 mai 2026 | — | Active |
| ACTIONS LAINES & TERRITOIRESÉtablissement 00015 | 107 125 890 | Quingey | 16 juin 2026 | — | Active |
| CHAMBRE INTERDEPARTEMENTALE D'AGRICULTURE DOUBS - TERRITOIRE DE BELFORTÉtablissement 00018 | 130 017 338 | Besançon | 1er janvier 2013 | 50 à 99 salariés | Active |
| CHAMBRE INTERDEPARTEMENTALE D'AGRICULTURE DOUBS - TERRITOIRE DE BELFORTÉtablissement 00034 | 130 017 338 | Houtaud | 1er janvier 2013 | 50 à 99 salariés | Active |
| CHAMBRE INTERDEPARTEMENTALE D'AGRICULTURE DOUBS - TERRITOIRE DE BELFORTÉtablissement 00042 | 130 017 338 | Valdahon | 1er janvier 2013 | 50 à 99 salariés | Active |
| CHAMBRE REGIONALE D'AGRICULTURE DE BOURGOGNE-FRANCHE-COMTEÉtablissement 00020 | 130 021 710 | École-Valentin | 1er janvier 2016 | 50 à 99 salariés | Active |
| CCI REGION BOURGOGNE-FRANCHE-COMTEÉtablissement 00029 | 130 022 569 | Montbéliard | 1er janvier 2017 | 250 à 499 salariés | Active |
| CCI REGION BOURGOGNE-FRANCHE-COMTEÉtablissement 00292 | 130 022 569 | Besançon | 1er janvier 2017 | 250 à 499 salariés | Active |
| CCI REGION BOURGOGNE-FRANCHE-COMTEÉtablissement 00300 | 130 022 569 | Besançon | 1er janvier 2017 | 250 à 499 salariés | Active |
| CCI REGION BOURGOGNE-FRANCHE-COMTEÉtablissement 00326 | 130 022 569 | Pontarlier | 1er janvier 2017 | 250 à 499 salariés | Active |
| CHAMBRE DE METIERS ET DE L'ARTISANAT DE REGION BOURGOGNE FRANCHE-COMTEÉtablissement 00101 | 130 026 073 | Besançon | 1er janvier 2020 | 250 à 499 salariés | Active |
| CHAMBRE DE COMMERCE ET D'INDUSTRIE TERRITORIALE SAONE-DOUBSÉtablissement 00018 | 130 029 143 | Besançon | 1er février 2021 | 3 à 5 salariés | Active |
| CHAMBRE DE COMMERCE ET D'INDUSTRIE TERRITORIALE SAONE-DOUBSÉtablissement 00034 | 130 029 143 | Montbéliard | 1er février 2021 | 3 à 5 salariés | Active |
| CHAMBRE DE COMMERCE ET D'INDUSTRIE TERRITORIALE SAONE-DOUBSÉtablissement 00059 | 130 029 143 | Pontarlier | 1er février 2021 | 3 à 5 salariés | Active |
| CHAMBRES D'AGRICULTURE FRANCEÉtablissement 00287 | 180 070 047 | École-Valentin | 1er janvier 1982 | 500 à 999 salariés | Active |
| CHAMBRES D'AGRICULTURE FRANCEÉtablissement 01129 | 180 070 047 | Besançon | 1er janvier 1982 | 500 à 999 salariés | Active |
| SYNDICAT CLUB CONFORT GAZÉtablissement 00023 | 307 016 865 | Valentigney | 31 décembre 1978 | — | Active |
| CHAMBRE SYNDICALE DES PROMOTEURSÉtablissement 00015 | 307 020 594 | Besançon | — | — | Active |
| SYND FABRIC AFFINEURS EMMENTALS TRADITÉtablissement 00015 | 312 311 871 | Besançon | 1er janvier 1978 | — | Active |
| UNION DES METIERS VIANDE ET GASTRONOMIEÉtablissement 00059 | 314 929 092 | Besançon | 1er janvier 1979 | — | Active |
| SYNDICAT MIXTE AGRICOLEÉtablissement 00019 | 329 394 324 | Jougne | 1er janvier 1984 | — | Active |
| UNION REG FRANCHE COMTE FNRCÉtablissement 00021 | 333 019 735 | Besançon | 1er juin 1985 | — | Active |
| SYND PROF E S F SOURCE DOUBSÉtablissement 00019 | 333 020 972 | Mouthe | 15 mars 1985 | 1 ou 2 salariés | Active |
| SYNDICAT DU PATRONAT DE FRANCHE COMTEÉtablissement 00017 | 338 657 232 | École-Valentin | 15 mars 1986 | — | Active |
| PILOTECÉtablissement 00012 | 350 273 470 | Besançon | 1er mars 1989 | — | Active |
| ECOLE DU SKI FRANCAISÉtablissement 00015 | 352 581 540 | Métabief | 31 décembre 1984 | 1 ou 2 salariés | Active |
| SYND AUTONOME INTERNES MEDECINE BESANCONÉtablissement 00018 | 353 243 199 | Besançon | 2 janvier 1990 | — | Active |
| UNION REG COIFFURE FRANCHE COMTEÉtablissement 00030 | 380 244 178 | Besançon | 1er octobre 1986 | — | Active |
| CHAMBRE REGIONALE PROSFESSIONS LIBERALESÉtablissement 00011 | 383 519 816 | Besançon | 1er février 1982 | — | Active |
| SYNDICAT APICOLE DU DOUBSÉtablissement 00028 | 387 788 292 | Besançon | 1er janvier 1986 | — | Active |
| SYNDICAT DEPARTEMENTAL TAXIS DU DOUBSÉtablissement 00012 | 389 118 464 | Besançon | 1er juillet 1992 | — | Active |
| FOND ASSUR FORMAT EXPLOITANTS AGRICOLESÉtablissement 00067 | 393 517 719 | Besançon | 1er janvier 1994 | — | Active |
| FEDERAT DEPART SYNDICAT EXPLOITANT AGRICÉtablissement 00014 | 401 025 168 | Besançon | 15 juillet 1948 | 10 à 19 salariés | Active |
| INSTITUT DIRIGEANTS D'ENTREPRISEÉtablissement 00015 | 420 256 059 | Besançon | 11 mai 1998 | — | Active |
| JEUNES AGRICULTEURS DE FRANCHE COMTEÉtablissement 00017 | 423 422 559 | Besançon | 1er juillet 1999 | — | Active |
| SYNDICAT LOCAL ESF LES FOURGSÉtablissement 00018 | 428 662 845 | Les Fourgs | 25 septembre 1998 | — | Active |
| FREDON DOUBS ET TERRITOIRE DE BELFORTÉtablissement 00026 | 435 229 935 | École-Valentin | 26 février 1999 | — | Active |
| VIVEAÉtablissement 00077 | 440 656 247 | École-Valentin | 1er janvier 2002 | 50 à 99 salariés | Active |
| SYNDICAT PASTORAL HOUTAUDÉtablissement 00013 | 441 392 800 | Houtaud | 20 septembre 1995 | — | Active |
| SYNDICAT PASTORALÉtablissement 00015 | 442 829 461 | Les Bréseux | 1er janvier 1980 | — | Active |
| SYNDICAT PASTORALÉtablissement 00010 | 442 829 487 | Maisons-du-Bois-Lièvremont | 1er janvier 1980 | — | Active |
| SYNDICAT PASTORALÉtablissement 00014 | 442 829 503 | Maisons-du-Bois-Lièvremont | 1er janvier 1980 | — | Active |
| SYNDICAT PASTORALÉtablissement 00017 | 442 829 511 | Remoray-Boujeons | 1er janvier 1980 | — | Active |
| SYNDICAT PASTORAL DE FEULEÉtablissement 00011 | 442 829 552 | Feule | 1er janvier 1987 | — | Active |
| SYNDICAT PASTORAL DE VUILLECINÉtablissement 00011 | 443 248 604 | Vuillecin | 30 septembre 1999 | — | Active |
| SYNDICAT LOCAL DES MONITEURS DE SKI ESIÉtablissement 00014 | 489 129 031 | Métabief | 1er décembre 2005 | 3 à 5 salariés | Active |
| CHAMBRE SYNDICALE DE L'ARTISANAT DES TRAVAUX PUBLICS DES PAYSAGISTES ET DES ACTIVITES ANNEXESÉtablissement 00011 | 503 126 815 | Besançon | 18 mars 2004 | — | Active |
| SYNDICAT PASTORAL D AUBONNEÉtablissement 00018 | 510 576 770 | Aubonne | 26 novembre 2008 | — | Active |
| SYNDICAYT PASTORAL DE LA CHAUX DE GILLEYÉtablissement 00016 | 510 582 729 | La Chaux | 22 avril 2008 | — | Active |
| SYNDICAT PASTORAL DE CLERONÉtablissement 00012 | 510 582 745 | Cléron | 1er avril 2008 | — | Active |