| SYNDICAT COPROPRIETE LES VIGNESÉtablissement 00010 | 013 877 816 | POLIGNY | 25 décembre 1994 | — | Active |
| SYNDICAT COPROPRIETE JACQUOTÉtablissement 00017 | 013 877 832 | POLIGNY | 25 décembre 1994 | — | Active |
| MAUTO39Établissement 00014 | 100 814 136 | POLIGNY | 4 février 2026 | — | Active |
| MEUNIER HUGO SASÉtablissement 00013 | 100 894 138 | POLIGNY | 2 février 2026 | — | Active |
| ASSOCIATION DES ANCIENS COMBATTANTS D'ALGERIE, MAROC ET TUNISIE, COMITE DE POLIGNY FNACAÉtablissement 00018 | 101 174 084 | POLIGNY | 24 juin 1966 | — | Active |
| IMMO 21Établissement 00011 | 101 381 044 | POLIGNY | 18 février 2026 | — | Active |
| MINCEUR BIEN ETREÉtablissement 00015 | 101 475 663 | POLIGNY | 19 février 2026 | — | Active |
| JURA COUVERTUREÉtablissement 00015 | 101 490 456 | POLIGNY | 23 février 2026 | — | Active |
| ARS TERRAE VINIÉtablissement 00011 | 102 259 603 | POLIGNY | 21 octobre 2025 | — | Active |
| MBAYE INVESTÉtablissement 00016 | 102 401 171 | POLIGNY | 12 mars 2026 | — | Active |
| WORLISMEÉtablissement 00017 | 102 451 523 | POLIGNY | 13 mars 2026 | — | Active |
| LA VOUIVREÉtablissement 00019 | 103 186 664 | POLIGNY | 30 mars 2026 | — | Active |
| MAVIÉtablissement 00012 | 103 228 276 | POLIGNY | 31 mars 2026 | — | Active |
| L'OISEAU RODEURÉtablissement 00017 | 105 220 529 | POLIGNY | 15 mai 2026 | — | Active |
| L'OISEAU RODEURÉtablissement 00025 | 105 220 529 | POLIGNY | 15 mai 2026 | — | Active |
| L'OISEAU RODEURÉtablissement 00033 | 105 220 529 | POLIGNY | 15 mai 2026 | — | Active |
| ZFAÉtablissement 00010 | 106 094 279 | POLIGNY | 8 juin 2026 | — | Active |
| ML PRESTABATÉtablissement 00011 | 106 137 136 | POLIGNY | 1er juin 2026 | — | Active |
| INDIVISION JEAN-BAPTISTE BRELOT CECILE GAILLARDÉtablissement 00018 | 107 118 119 | POLIGNY | 1er janvier 2026 | — | Active |
| VERARISÉtablissement 00010 | 107 631 301 | POLIGNY | 14 juillet 2026 | — | Active |
| INDIVISION ROQUEMAURELÉtablissement 00012 | 108 075 193 | POLIGNY | 23 juillet 2026 | — | Active |
| POLIGNY EN FETEÉtablissement 00013 | 108 187 915 | POLIGNY | 7 juillet 2026 | — | Active |
| PVREACTIVEÉtablissement 00018 | 108 461 054 | POLIGNY | 20 juillet 2026 | — | Active |
| CAZZINIÉtablissement 00017 | 108 857 814 | POLIGNY | 12 août 2026 | — | Active |
| INDIVISION FREDERIC VIEL AURELIE KUSIAKÉtablissement 00013 | 109 952 614 | POLIGNY | 28 juillet 2026 | — | Active |
| DIRECTION INTERDEPARTEMENTALE DES ROUTES ESTÉtablissement 00182 | 130 001 530 | POLIGNY | 16 mars 2006 | 500 à 999 salariés | Active |
| DIRECTION DEPARTEMENTALE FINANCES PUBLIQUES JURAÉtablissement 00219 | 130 011 448 | POLIGNY | 31 mars 2010 | 250 à 499 salariés | Active |
| INSTITUT NATIONAL DE RECHERCHE POUR L'AGRICULTURE L'ALIMENTATION ET L'ENVIRONNEMENTÉtablissement 00698 | 180 070 039 | POLIGNY | 1er janvier 1982 | 10 000 salariés et plus | Active |
| LYCEE POLYVALENT HYACINTHE FRIANT- LYCEE DES METIERS DE L HOTELLERIE-RESTAURATION ET DU SANITAIRE ET SOCIALÉtablissement 00014 | 193 900 339 | POLIGNY | 1er mai 1965 | 100 à 199 salariés | Active |
| COLLEGE JULES GREVYÉtablissement 00013 | 193 907 987 | POLIGNY | 5 mars 1969 | 20 à 49 salariés | Active |
| ETABLISSEMENT PUBLIC LOCAL D'ENSEIGNEMENT ET DE FORMATION PROFESSIONNELLE AGRICOLES DE MAMIROLLE-POLIGNYÉtablissement 00017 | 193 908 126 | POLIGNY | 1er mars 1983 | 100 à 199 salariés | Active |
| ETABLISSEMENT PUBLIC LOCAL D'ENSEIGNEMENT ET DE FORMATION PROFESSIONNELLE AGRICOLES DE MAMIROLLE-POLIGNYÉtablissement 00025 | 193 908 126 | POLIGNY | 1er mars 1983 | 100 à 199 salariés | Active |
| ETABLISSEMENT PUBLIC LOCAL D'ENSEIGNEMENT ET DE FORMATION PROFESSIONNELLE AGRICOLES DE MAMIROLLE-POLIGNYÉtablissement 00074 | 193 908 126 | POLIGNY | 1er mars 1983 | 100 à 199 salariés | Active |
| CC ARBOIS, POLIGNY, SALINS, COEUR DU JURAÉtablissement 00041 | 200 071 595 | POLIGNY | 1er janvier 2017 | 200 à 249 salariés | Active |
| CC ARBOIS, POLIGNY, SALINS, COEUR DU JURAÉtablissement 00074 | 200 071 595 | POLIGNY | 1er janvier 2017 | 200 à 249 salariés | Active |
| CC ARBOIS, POLIGNY, SALINS, COEUR DU JURAÉtablissement 00108 | 200 071 595 | POLIGNY | 1er janvier 2017 | 200 à 249 salariés | Active |
| CC ARBOIS, POLIGNY, SALINS, COEUR DU JURAÉtablissement 00124 | 200 071 595 | POLIGNY | 1er janvier 2017 | 200 à 249 salariés | Active |
| CC ARBOIS, POLIGNY, SALINS, COEUR DU JURAÉtablissement 00132 | 200 071 595 | POLIGNY | 1er janvier 2017 | 200 à 249 salariés | Active |
| DEPARTEMENT DU JURAÉtablissement 00289 | 223 900 010 | POLIGNY | 1er janvier 1978 | 1 000 à 1 999 salariés | Active |
| DEPARTEMENT DU JURAÉtablissement 00511 | 223 900 010 | POLIGNY | 1er janvier 1978 | 1 000 à 1 999 salariés | Active |
| CENTRE HOSPITALIER INTERCOMMUNAL DU PAYS DU REVERMONTÉtablissement 00111 | 263 900 128 | POLIGNY | 1er mars 1983 | 500 à 999 salariés | Active |
| CENTRE HOSPITALIER SAINT YLIE JURAÉtablissement 00522 | 263 900 144 | POLIGNY | 1er mars 1983 | 1 000 à 1 999 salariés | Active |
| ASSOCIATION FONCIERE DE POLIGNYÉtablissement 00019 | 293 904 348 | POLIGNY | 3 juillet 1970 | — | Active |
| SOC GERANCE DISTRIBUTIONS EAUÉtablissement 00783 | 301 192 803 | POLIGNY | 1er janvier 1954 | 250 à 499 salariés | Active |
| SCM TOITOT CLADYÉtablissement 00010 | 301 212 403 | POLIGNY | 1er janvier 1900 | — | Active |
| ETS COSTEÉtablissement 00082 | 301 767 729 | POLIGNY | 1er janvier 1964 | 100 à 199 salariés | Active |
| CENTRE TECHNIQUE DES FROMAGES COMTOISÉtablissement 00034 | 303 216 725 | POLIGNY | 1er janvier 1900 | 20 à 49 salariés | Active |
| LES MESSAGERIES JURASSIENNESÉtablissement 00023 | 306 215 187 | POLIGNY | 1er janvier 1976 | 20 à 49 salariés | Active |
| SOCIETE CIVILE ARNAUDÉtablissement 00011 | 311 702 815 | POLIGNY | 1er janvier 1900 | — | Active |
| MICROBATÉtablissement 00039 | 314 550 021 | POLIGNY | 1er janvier 1978 | 3 à 5 salariés | Active |