| FONDS DE RECONVERSION AGRICOLE DE JOUX-LA-VILLEÉtablissement 00016 | 130 758 915 | Joux-la-Ville | 29 septembre 2026 | — | Active |
| POLE DE FORMATION ET DE RESEAU - SENSÉtablissement 00014 | 130 764 012 | Sens | 2 août 2026 | — | Active |
| CONSEIL DEPARTEMENTAL ORDRE DES MEDECINSÉtablissement 00054 | 301 789 889 | Auxerre | — | 3 à 5 salariés | Active |
| ORDRE AVOCAT BARREAU DE SENSÉtablissement 00014 | 326 206 125 | Sens | 1er décembre 1981 | 1 ou 2 salariés | Active |
| ASS EUROPEENNE MARCHANDS MACHINES OUTILSÉtablissement 00061 | 347 832 248 | Auxerre | 1er février 1988 | — | Active |
| YONNE DEVELOPPEMENTÉtablissement 00029 | 350 926 051 | Auxerre | 27 février 1989 | — | Active |
| ORDRE DEPART CHIRURGIENS DENTISTES YONNEÉtablissement 00033 | 379 214 067 | Joigny | 18 juillet 1990 | 1 ou 2 salariés | Active |
| GPT CONCESSIONNAIRES DAF FRANCE S.T.V.I.Établissement 00040 | 390 401 685 | Appoigny | 30 octobre 1992 | — | Active |
| ASS SECR EMPL ADMN MAIRIE ARROND SENSÉtablissement 00013 | 390 700 474 | Véron | 1er janvier 1986 | — | Active |
| CLUB PROGRES DES INDUSTRIES AGRO ALIMENTÉtablissement 00017 | 393 424 122 | Auxerre | 7 septembre 1993 | — | Active |
| ASSOC POUR LE DEVELOPPEMENT AUXERROISÉtablissement 00010 | 398 360 321 | Auxerre | 16 août 1994 | — | Active |
| UNION COMMERC ARTISAN DE CHAMPIGNYÉtablissement 00027 | 398 421 339 | Champigny | 1er janvier 1993 | — | Active |
| ASS. SERVICES POUR INDUSTRIE ET COMMERCEÉtablissement 00017 | 399 022 425 | Auxerre | 1er août 1994 | 10 à 19 salariés | Active |
| SYNDICAT DES APICULTEURS DE L YONNEÉtablissement 00011 | 399 296 060 | Auxerre | 1er janvier 1994 | — | Active |
| ASSOC. DES PRODUCTEURS DE CORNICHONSÉtablissement 00011 | 407 947 118 | Auxerre | 1er juin 1992 | — | Active |
| CAISSE AUTONOME REGLEM.PECUNIAIRE AVOCATÉtablissement 00014 | 412 041 063 | Auxerre | 1er janvier 1997 | — | Active |
| BIENVENUE CHEZ LES COMMERCANTS DE JOIGNYÉtablissement 00014 | 412 655 797 | Joigny | 19 février 1997 | — | Active |
| FEDERATION DEPARTEMENTALE DU CNIPÉtablissement 00010 | 419 348 958 | Chailley | 11 mai 1998 | — | Active |
| UNION NATIONALE DES ENTREPRISES DE COIFFURE DE L'YONNEÉtablissement 00027 | 421 016 957 | Auxerre | 1er janvier 1987 | 3 à 5 salariés | Active |
| CDDPÉtablissement 00010 | 421 087 925 | Auxerre | 15 septembre 1979 | — | Active |
| SCICA AGRORESOÉtablissement 00019 | 432 932 838 | Monéteau | 1er mars 2000 | 1 ou 2 salariés | Active |
| UNION LOCALE CFTCÉtablissement 00018 | 434 505 053 | Migennes | 1er mars 2001 | — | Active |
| ASSOC. ANESTHESISTES CLINIQUE P.PICQUETÉtablissement 00029 | 434 640 728 | Sens | 1er juillet 1996 | 3 à 5 salariés | Active |
| CONFEDERAT.GPT AGROBIOLOGISTES BOURGOGNEÉtablissement 00011 | 441 684 362 | Auxerre | 1er janvier 1980 | — | Active |
| MAIRES DE L' YONNEÉtablissement 00040 | 442 943 734 | Auxerre | 5 août 2002 | 1 ou 2 salariés | Active |
| ASS ANIMATION PROMOTION DEV EMPLOI RURALÉtablissement 00015 | 443 631 510 | Auxerre | 11 juillet 2000 | — | Active |
| FEDERATION DEP HOTELLER PLEIN AIR YONNEÉtablissement 00018 | 444 836 241 | Tonnerre | 25 mai 1989 | — | Active |
| UNION COMMERCIALE ARTISANALE DU CANTONÉtablissement 00010 | 450 492 905 | Noyers | 7 mai 2003 | — | Active |
| ORDRE NATIONAL DES PEDICURES PODOLOGUESÉtablissement 00110 | 493 318 661 | Auxerre | 14 décembre 2006 | 20 à 49 salariés | Active |
| CHAMBRE FNAIM DE L'IMMOBILIER DE YONNEÉtablissement 00022 | 497 488 049 | Auxerre | 12 janvier 2006 | — | Active |
| FEDERATION DEFENSE APPELLATION CHABLISÉtablissement 00020 | 497 964 155 | Chablis | 1er mai 2007 | 1 ou 2 salariés | Active |
| CONSEIL DEPARTEMENTAL ORDRE MASSEURS KINESITHERAPEUTE YONNEÉtablissement 00022 | 497 990 549 | Auxerre | 27 juin 2006 | 1 ou 2 salariés | Active |
| ASSOCIATION SANITAIRE APICOLE DU DEPARTEMENT DE L'YONNEÉtablissement 00022 | 504 387 358 | Auxerre | 19 novembre 1948 | — | Active |
| GROUPEMENT DES AGROBIOLOGISTES DE L 'YONNEÉtablissement 00010 | 521 333 468 | Auxerre | 15 mai 2003 | — | Active |
| CONSEIL DEPARTEMENTALE DE L ORDRE DES SAGES FEMMES DE L YONNEÉtablissement 00015 | 539 906 743 | Joigny | 14 mars 2008 | — | Active |
| FEDERAT DEP SYND EXPLOIT AGRICOLE YONNEÉtablissement 00028 | 778 649 319 | Auxerre | — | 10 à 19 salariés | Active |
| UNION DES METIERS ET DES INDUSTRIES DE L HOTELLERIE DE L YONNEÉtablissement 00051 | 778 649 343 | Auxerre | 1er janvier 1980 | 1 ou 2 salariés | Active |
| UNION INDUSTRIES METIERS METALLURGIE YONÉtablissement 00034 | 778 649 400 | Auxerre | — | 6 à 9 salariés | Active |
| SYND DES MEDECINS DE L YONNEÉtablissement 00025 | 778 649 434 | Auxerre | — | — | Active |
| ASSOC SYNDICALE PHARMACIENS DE L YONNEÉtablissement 00043 | 778 681 593 | Joigny | — | — | Active |
| ASSOCIATION POUR BATIR RENOVER INNOVER SAINEMENT (ABRIS)Établissement 00012 | 793 682 642 | Saint-Sauveur-en-Puisaye | 25 avril 2013 | — | Active |
| RESEAU DES PROFESSIONNELS DU TOURISME DE PUISAYE FORTERREÉtablissement 00022 | 808 581 664 | Toucy | 23 janvier 2014 | — | Active |
| GROUPEMENT DE VULGARISATION AGRICOLE DE LA REGION D'AUXERREÉtablissement 00017 | 817 666 407 | Auxerre | 21 décembre 2015 | — | Active |
| ASSOCIATION DES PROFESSIONNELS DE SANTE DE COURSON LES CARRIERESÉtablissement 00015 | 840 188 809 | Courson-les-Carrières | 28 janvier 2011 | — | Active |
| CROPP BOURGOGNE FRANCHE-COMTEÉtablissement 00018 | 842 749 939 | Auxerre | 21 juin 2018 | — | Active |
| ASSOCIATION DES PROFESSIONNELS DE SANTE DU CANTON COEUR DE PUISAYEÉtablissement 00017 | 843 138 033 | Villiers-Saint-Benoît | 21 avril 2016 | — | Active |
| UNION NATIONALE DES ENTREPRISES DE COIFFURE BOURGOGNE FRANCHE-COMTEÉtablissement 00019 | 847 538 865 | Auxerre | 11 janvier 2019 | — | Active |
| KUB - KICK UP BUSINESSÉtablissement 00017 | 884 909 854 | Auxerre | 6 janvier 2020 | — | Active |
| L'ANTRE DES IMAGINAIRESÉtablissement 00010 | 891 430 316 | Tanlay | 16 novembre 2020 | — | Active |
| AIDE PSYCHOLOGIQUE AUX ENTREPRENEURS EN SOUFFRANCE AIGUEÉtablissement 00011 | 893 002 600 | Auxerre | 4 janvier 2021 | — | Active |