| LA FAILLEÉtablissement 00014 | 104 979 265 | Salins-les-Bains | 1er avril 2026 | — | Active |
| BUSIDOLEÉtablissement 00010 | 106 447 808 | Dole | 9 mars 2023 | — | Active |
| CCI REGION BOURGOGNE-FRANCHE-COMTEÉtablissement 00045 | 130 022 569 | Lons-le-Saunier | 1er janvier 2017 | 250 à 499 salariés | Active |
| CCI REGION BOURGOGNE-FRANCHE-COMTEÉtablissement 00052 | 130 022 569 | Dole | 1er janvier 2017 | 250 à 499 salariés | Active |
| CHAMBRE DE METIERS ET DE L'ARTISANAT DE REGION BOURGOGNE FRANCHE-COMTEÉtablissement 00010 | 130 026 073 | Dole | 1er janvier 2020 | 250 à 499 salariés | Active |
| CHAMBRE DE METIERS ET DE L'ARTISANAT DE REGION BOURGOGNE FRANCHE-COMTEÉtablissement 00085 | 130 026 073 | Lons-le-Saunier | 1er janvier 2020 | 250 à 499 salariés | Active |
| CHAMBRE D AGRICULTURE DU JURAÉtablissement 00015 | 183 900 018 | Lons-le-Saunier | 1er janvier 1978 | 50 à 99 salariés | Active |
| CHAMBRE DE COMMERCE ET D'INDUSTRIE JURAÉtablissement 00018 | 183 900 026 | Lons-le-Saunier | 1er janvier 1950 | — | Active |
| CONFEDERATION NATIONALE CHAUFF ROUTIERSÉtablissement 00013 | 300 412 350 | Dole | — | — | Active |
| GROUP INTERPR DEPART ARTISANALÉtablissement 00018 | 312 539 844 | Lons-le-Saunier | 1er janvier 1978 | — | Active |
| SYNDICAT PRODUCTEURS DE LAITÉtablissement 00013 | 317 168 722 | Les Bouchoux | 1er janvier 1979 | — | Active |
| SYND ESF DE LAMOURAÉtablissement 00013 | 328 997 861 | Lamoura | 1er janvier 1984 | 1 ou 2 salariés | Active |
| SYND ESF LES ROUSSESÉtablissement 00011 | 328 999 842 | Les Rousses | 1er janvier 1984 | 3 à 5 salariés | Active |
| SYND DES CHIRURGIENS DENTISTES DU JURAÉtablissement 00031 | 338 454 853 | Lons-le-Saunier | 1er octobre 1985 | 1 ou 2 salariés | Active |
| FEDERATION DEPART BOULANGERIE DU JURAÉtablissement 00013 | 379 002 736 | Lons-le-Saunier | 24 mai 1990 | — | Active |
| COORDINATION RURALE - UNION NATIONALEÉtablissement 00084 | 401 348 552 | Fraisans | 1er juillet 1969 | 20 à 49 salariés | Active |
| COORDINATION RURALE - UNION NATIONALEÉtablissement 00225 | 401 348 552 | Gendrey | 1er juillet 1969 | 20 à 49 salariés | Active |
| GROUPEMENT PASTORAL DE RIX TREBIEFÉtablissement 00015 | 411 698 962 | Rix | 1er janvier 1997 | — | Active |
| SYNDICAT CAFETIERS HOTELIERS HAUT JURAÉtablissement 00023 | 418 688 461 | Saint-Claude | 15 décembre 1997 | — | Active |
| ECOLE DE SKI FRANCAIS DU HAUT JURAÉtablissement 00012 | 418 813 739 | La Pesse | 26 décembre 1997 | — | Active |
| ECOLE DE SKI FRANCAIS DU HAUT JURAÉtablissement 00020 | 418 813 739 | Les Moussières | 26 décembre 1997 | — | Active |
| ECOLE DE SKI FRANCAIS DU HAUT JURAÉtablissement 00038 | 418 813 739 | Lajoux | 26 décembre 1997 | — | Active |
| SYND LOCAL DES MONITEURS DU SKI FRANCAISÉtablissement 00015 | 428 730 469 | Bellefontaine | 1er novembre 1999 | 1 ou 2 salariés | Active |
| CREATIVEWOOD UNION FRANCAISE DES PROFESSIONS DE L'OBJET BOIS & MATIERESÉtablissement 00039 | 428 762 512 | Lect | 10 décembre 1999 | — | Active |
| CONFEDERATION PAYSANNEÉtablissement 00048 | 443 358 361 | Lons-le-Saunier | 1er août 2002 | 1 ou 2 salariés | Active |
| COORDINATION RURALE UNION REGIONALE DE BOURGOGNE FRANCHE COMTEÉtablissement 00036 | 499 427 094 | Gendrey | 1er novembre 2003 | — | Active |
| COORDINATION RURALE DU JURAÉtablissement 00039 | 508 517 836 | Gendrey | 22 février 2006 | — | Active |
| JEUNES AGRICULTEURS DU HAUT JURAÉtablissement 00010 | 510 610 264 | La Pesse | 1er janvier 2009 | — | Active |
| UNION DES INDUSTRIES DES METIERS DE LA METALLURGIE DE FRANCHE COMTEÉtablissement 00033 | 533 335 758 | Dole | 1er janvier 2011 | 10 à 19 salariés | Active |
| SERVICE DE PREVENTION ET DE SANTE AU TRAVAIL INTERENTREPRISES DU BTP DE BOURGOGNE FRANCHE-COMTEÉtablissement 00098 | 775 571 250 | Lons-le-Saunier | — | 50 à 99 salariés | Active |
| SERVICE DE PREVENTION ET DE SANTE AU TRAVAIL INTERENTREPRISES DU BTP DE BOURGOGNE FRANCHE-COMTEÉtablissement 00106 | 775 571 250 | Dole | — | 50 à 99 salariés | Active |
| MEDEF TERRITOIRES FRANC-COMTOISÉtablissement 00043 | 778 297 143 | Dole | — | 6 à 9 salariés | Active |
| FEDER DEPART BATIM TRAVAUX PUBLICS JURAÉtablissement 00023 | 778 383 307 | Dole | — | 3 à 5 salariés | Active |
| UNION ET RASSEMBLEMENT DU COMMERCEÉtablissement 00020 | 778 383 323 | Dole | — | — | Active |
| SYND DEPART TRPT ROUTIERS JURAÉtablissement 00019 | 778 396 218 | Lons-le-Saunier | — | — | Active |
| FEDER DEP SYND EXPLOIT AGRICÉtablissement 00027 | 778 396 242 | Lons-le-Saunier | — | 6 à 9 salariés | Active |
| FEDERATION REGIONALE DES COOPERATIVES LAITIERES DU MASSIF JURASSIENÉtablissement 00047 | 778 396 259 | Poligny | — | 10 à 19 salariés | Active |
| CHAMBRE ARTISAN PETITE ENTRP BAT DU JURAÉtablissement 00032 | 778 396 291 | Lons-le-Saunier | — | 3 à 5 salariés | Active |
| UN DEP SYND INDUST HOTELIEREÉtablissement 00053 | 778 396 325 | Lons-le-Saunier | 1er juin 1983 | 1 ou 2 salariés | Active |
| SYNDICAT DES MEUNIERS DU JURAÉtablissement 00027 | 778 396 341 | Patornay | — | — | Active |
| UNION DEPART DES OT ET SI JURAÉtablissement 00021 | 778 396 358 | Lons-le-Saunier | — | — | Active |
| COMMANDERIE DES NOBLES VINSÉtablissement 00036 | 778 396 374 | Lons-le-Saunier | — | — | Active |
| CENTRE DEP JEUNES AGRICULTEURSÉtablissement 00020 | 778 397 117 | Lons-le-Saunier | 10 juillet 1985 | 1 ou 2 salariés | Active |
| LES ENTREPRISES DE LUNETTERIE DU MASSIF JURASSIENÉtablissement 00028 | 778 405 910 | Hauts de Bienne | — | — | Active |
| COMITE INTERPROFESSIONNEL DE GESTION DU COMTEÉtablissement 00038 | 778 413 278 | Poligny | — | 10 à 19 salariés | Active |
| CHAMBRE SYNDICALE PATRONALEÉtablissement 00019 | 778 422 774 | Saint-Claude | — | — | Active |
| OFFICE DU COMMERCE DU GRAND DOLEÉtablissement 00010 | 813 687 530 | Dole | 27 mars 2013 | 3 à 5 salariés | Active |
| FEDERATION DES TAXIS DU JURAÉtablissement 00012 | 839 238 029 | Cramans | 6 avril 2018 | — | Active |
| LES RAVACHOLESÉtablissement 00010 | 889 248 159 | Broissia | 30 juin 2020 | — | Active |
| LE LABO RURAL : METHODE ET AUDACEÉtablissement 00012 | 894 044 726 | Sapois | 19 juillet 2019 | — | Active |